Родился 5 января 1950 года. Окончив в 1966 году школу с медалью, поступил на химический факультет Бакинского государственного университета и в 1971 году окончил его. В 1973 году поступил в аспирантуру Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова, в 1976 году защитил кандидатскую, а в 1991 году – докторскую диссертацию, с того же года является профессором. С 1993 по 1999 год являлся деканом химического факультета БГУ, а с 1999 года – ректор Бакинского государственного университета. С 2002 года заведует кафедрой органической химии. По его инициативе при кафедре была создана научно-исследовательская лаборатория “Тонкий органический синтез”.

Сфера охвата научных исследований, будучи многогранна, включает различные области химии (органическую, полимерную, нефтехимию, наноматериалы и кристаллохимию и пр.). Под его руководством в университете был создан Центр высоких технологий.

В 2000 году А.М.Магеррамов был удостоен почетного звания “Заслуженный деятель науки”, а в 2009 году награжден орденом “Шохрат”. В 2001 году был избран членом-корреспондентом, а в 2007 году – действительным членом НАНА.

В 2000 году за плодотворную деятельность в области науки и технологии был удостоен Золотой медали Организации экономического сотрудничества, в 2004 году - высшего ордена Румынии “Золотая Звезда” степени Командор а, в 2012 году – Премии ИСЕСКО в области науки и технологии. Почетный доктор университетов многих стран (Турции, России, Казахстана, Румынии и др.), в том числе Почётный профессор Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова, а с 2014 года – член АН Грузии.

Автор более 1200 научных работ, опубликованных в Азербайджане и за рубежом, в том числе 54 патентов, 19 монографий, 51 учебника и учебного пособия. Под его руководством подготовлено более 50 докторов химических наук и докторов философии по химическим наукам. С 2000 года является председателем созданного при БГУ Совета по защите докторских и кандидатских диссертаций по специальности “Органическая химия”

В 2005 и 2010 годах был избран в Милли Меджлис Азербайджанской Республики III и IV созыва.