1972-ci ildə ADU-nun kimya fakültəsini bitirdikdən sonra zabit rüt­bəsində ordu sırala­rında xidmət etmiş, 1974-cü ildən AMEA-nın Aşqarlar Kimyası İnstitutunda laborant, mühəndis vəzifələrində çalışmış, 1976-cı ildə aspiranturaya daxil olmuş, 1981-ci ildə aspiranturanı müvəffəqiyyətlə başa vuraraq dissertasiya müdafiə edərək kimya elm­ləri namizədi elmi dərəcəsini almışdır. Elə həmin ildə də Rəyasət Heyətinin qərarı ilə Aşqarlar Kimyası İnstitutunun elmi işlər üzrə direktor müa­vini vəzifəsinə təyin olunmuşdur. F.Əliyevin bilavasitə çalışdığı sahə yeni kükürd-üzvi bir­ləş­mələrin sintezi və onlardan aşqarlar kimi istifadə etməklə müxtəlif xassələrə malik sürtgü yağlarının alınmasında istifadə olunmasıdır. 1983-cü ildən Gəncə Regional Elmi Mərkəzinin sədridir. F.Əliyev 1992-ci ildə doktorluq dissertasiyasını müvəffəqiyyətlə müdafiə edərək kimya elmləri doktoru elmi dərəcəsini almış, 2007-ci ildə isə AMEA-nın müxbir üzvü, 2014-cü ildə həqiqi üzvü seçilmişdir. 100-ə yaxın elmi əsər, 16 elmi ixtira, 5 monoqrafiyanın müəllifidir. AMEA-nın Gəncədə dərc olunan «Xəbərlər» məcmuəsinin baş redaktorudur. Alim 1996-cı ildən Gəncə şə­hər Ziyalılar Cəmiyyətinin sədri, Yeni Azərbaycan Partiyası Gəncə şəhər təşkilatının sədr müavinidir. F.Əliyev 2005-ci ildə Azərbaycan Respublikası Prezidentinin fərmanı ilə «Tərəqqi» medalına, 2006-cı ildə Əməkdar elm xadimi adına layiq görülmüşdür.